Специалисты Института индивидуальной онкологии Университета им. Сеченова Минздрава РФ разработали компьютерную модель, которая позволяет определять онкомаркеры нового поколения, необходимые для правильной диагностики и выбора стратегий лечения онкологических заболеваний
Он позволяет автоматически реконструировать тысячи внутриклеточных молекулярных путей, вызванных изменениями в работе 3000 генов.
Об этом «Газете.Ru» сказали в самом университете. Процесс превращения нормальных клеток в раковые сопровождается мощной реконструкцией генома. На эти изменения влияют 3000 генов. Их функции можно рассматривать как индивидуально, так и в контексте биологических процессов, за которые они несут ответственность. Персонализированные методы диагностики позволяют прогнозировать реакцию пациента на дальнейшее развитие заболевания и лечение на основе геномного и РНК-анализа опухолевых клеток.В настоящее время такой диагноз основывается на оценке работы генов, участвующих в изучении определенных сигнальных путей.
В этом случае уровень активации сигнального пути, способствующего развитию рака, действует как побочный эффект. Однако такой анализ не дает полной информации о процессе, и риск ошибок также высок. Исследователи разработали компьютерную модель, которая может идентифицировать и анализировать интерактом. Это совокупность всех взаимодействующих молекул, в первую очередь белковых молекул, в опухолевых клетках.
«Интера Декоммунизация может быть представлена в виде математического графика — совокупности точек, где каждая точка является продуктом гена, например белком, и связей между ними. И наша модель заключается в том, что мы идентифицируем сотни тысяч межм декомолекулярных взаимодействий, таких как определение связей с другими для каждой точки, а количество и качество маркеров рака, полученных с использованием нового алгоритма, который автоматически направляет молекулы каждой точки, намного выше по сравнению с теми, которые используются в настоящее время».
