Научные исследователи из Института цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук (ИЦиГ СО РАН) разработали программный комплекс, который поможет упорядочить и анализировать геномы микроорганизмов
Результаты исследования были опубликованы в сборнике конференции Parallel Computing Technologies.
Эта разработка имеет большое значение не только для систематизации данных в хранилище геномов, но и для проведения сравнительного анализа различных организмов. Это позволит ученым планировать и проводить новые генетические эксперименты, включая методы генной инженерии для добавления новых генов. В настоящее время в хранилище геномов микроорганизмов, с которым работают ученые из ИЦиГ, содержится информация о более чем 1500 штаммах. Данные в хранилище включают прочтения генома, полногеномные аннотации и математические модели.
Полногеномная аннотация является процессом получения полной последовательности генетической информации, передаваемой через геном, и анализа функциональных генов, содержащихся в нем. Созданный программный комплекс позволяет ученым сравнивать различные штаммы и прогнозировать новые свойства микроорганизмов.
Кроме того, исследователи ищут оптимальные метаболические пути для эффективного производства полезных веществ, таких как аминокислоты, путем изменения генетического состава или условий обитания микроорганизмов. Этот программный комплекс предоставляет ученым инструменты для поиска таких путей и оптимизации их использования.
